MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR

Total Repeats: 2291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012523	GCT	2	6	19	24	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334773
2	NC_012523	TGG	2	6	99	104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334773
3	NC_012523	GT	4	8	131	138	0 %	50 %	50 %	0 %	226334773
4	NC_012523	TCG	2	6	177	182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334773
5	NC_012523	CGGG	2	8	190	197	0 %	0 %	75 %	25 %	226334773
6	NC_012523	GA	3	6	230	235	50 %	0 %	50 %	0 %	226334773
7	NC_012523	GGCCG	2	10	242	251	0 %	0 %	60 %	40 %	226334773
8	NC_012523	GGT	2	6	253	258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334773
9	NC_012523	GTC	2	6	316	321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334773
10	NC_012523	GCG	2	6	342	347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334773
11	NC_012523	CCG	2	6	354	359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334773
12	NC_012523	GGC	2	6	397	402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334773
13	NC_012523	GATTCG	2	12	620	631	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226334774
14	NC_012523	TCG	2	6	653	658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334774
15	NC_012523	TTG	2	6	713	718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226334774
16	NC_012523	TGC	2	6	769	774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334774
17	NC_012523	CTCGA	2	10	839	848	20 %	20 %	20 %	40 %	226334774
18	NC_012523	GTCTCG	2	12	899	910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334774
19	NC_012523	GTC	2	6	943	948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334774
20	NC_012523	ACG	2	6	965	970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334774
21	NC_012523	GTC	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334774
22	NC_012523	CATCGA	2	12	1077	1088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	226334774
23	NC_012523	TATCGA	2	12	1089	1100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226334774
24	NC_012523	CT	3	6	1208	1213	0 %	50 %	0 %	50 %	226334774
25	NC_012523	CTC	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334774
26	NC_012523	CTG	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334774
27	NC_012523	GT	3	6	1265	1270	0 %	50 %	50 %	0 %	226334774
28	NC_012523	TGA	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334774
29	NC_012523	CGG	2	6	1330	1335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334774
30	NC_012523	GAT	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334774
31	NC_012523	GCCG	2	8	1393	1400	0 %	0 %	50 %	50 %	226334774
32	NC_012523	CTT	2	6	1416	1421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226334774
33	NC_012523	CGG	2	6	1430	1435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334774
34	NC_012523	TGA	2	6	1461	1466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334774
35	NC_012523	ACG	3	9	1472	1480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334774
36	NC_012523	GAA	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334774
37	NC_012523	CG	3	6	1510	1515	0 %	0 %	50 %	50 %	226334774
38	NC_012523	CAA	2	6	1536	1541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226334774
39	NC_012523	CGA	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334774
40	NC_012523	ACA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226334774
41	NC_012523	GC	3	6	1716	1721	0 %	0 %	50 %	50 %	226334774
42	NC_012523	TGC	2	6	1735	1740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334774
43	NC_012523	TCAT	2	8	1754	1761	25 %	50 %	0 %	25 %	226334774
44	NC_012523	AGCG	2	8	1845	1852	25 %	0 %	50 %	25 %	226334775
45	NC_012523	TCC	2	6	1876	1881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334775
46	NC_012523	CGT	2	6	1898	1903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334775
47	NC_012523	GCGCG	2	10	1910	1919	0 %	0 %	60 %	40 %	226334775
48	NC_012523	GCG	3	9	1930	1938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334775
49	NC_012523	CGG	2	6	1979	1984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334775
50	NC_012523	GC	3	6	2007	2012	0 %	0 %	50 %	50 %	226334775
51	NC_012523	TTG	2	6	2053	2058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226334775
52	NC_012523	CTT	2	6	2064	2069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226334775
53	NC_012523	CGGC	2	8	2078	2085	0 %	0 %	50 %	50 %	226334775
54	NC_012523	TTG	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226334775
55	NC_012523	CCT	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334775
56	NC_012523	CG	3	6	2173	2178	0 %	0 %	50 %	50 %	226334775
57	NC_012523	CGG	2	6	2193	2198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334775
58	NC_012523	GCC	2	6	2235	2240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334776
59	NC_012523	GCCTCA	2	12	2250	2261	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	226334776
60	NC_012523	GTGC	2	8	2329	2336	0 %	25 %	50 %	25 %	226334776
61	NC_012523	GAC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334776
62	NC_012523	GTC	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334776
63	NC_012523	TCT	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226334776
64	NC_012523	ACG	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334776
65	NC_012523	TCG	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334776
66	NC_012523	CGA	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334776
67	NC_012523	GAG	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226334776
68	NC_012523	CTC	2	6	2591	2596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334776
69	NC_012523	GTCT	2	8	2660	2667	0 %	50 %	25 %	25 %	226334776
70	NC_012523	TCG	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334776
71	NC_012523	AGC	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334776
72	NC_012523	GCA	2	6	2703	2708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334776
73	NC_012523	TCG	2	6	2721	2726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334776
74	NC_012523	GCG	2	6	2770	2775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334776
75	NC_012523	TCG	2	6	2818	2823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334776
76	NC_012523	GCG	2	6	2838	2843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334776
77	NC_012523	GAT	2	6	2873	2878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334776
78	NC_012523	TCG	3	9	2955	2963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334776
79	NC_012523	TCC	2	6	2988	2993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334776
80	NC_012523	CGA	2	6	3019	3024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334776
81	NC_012523	GTC	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334776
82	NC_012523	C	6	6	3093	3098	0 %	0 %	0 %	100 %	226334776
83	NC_012523	CGTG	2	8	3157	3164	0 %	25 %	50 %	25 %	226334776
84	NC_012523	GGT	2	6	3168	3173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334776
85	NC_012523	GTCGT	2	10	4081	4090	0 %	40 %	40 %	20 %	226334777
86	NC_012523	AGCT	2	8	4126	4133	25 %	25 %	25 %	25 %	226334777
87	NC_012523	TCG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334777
88	NC_012523	TGCT	2	8	4192	4199	0 %	50 %	25 %	25 %	226334777
89	NC_012523	CAA	2	6	4328	4333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226334777
90	NC_012523	CGAG	2	8	4385	4392	25 %	0 %	50 %	25 %	226334777
91	NC_012523	GTC	2	6	4416	4421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334777
92	NC_012523	CCTT	2	8	4435	4442	0 %	50 %	0 %	50 %	226334777
93	NC_012523	CGT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334777
94	NC_012523	ACC	2	6	4638	4643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334777
95	NC_012523	CG	3	6	4646	4651	0 %	0 %	50 %	50 %	226334777
96	NC_012523	ATTC	2	8	4696	4703	25 %	50 %	0 %	25 %	226334777
97	NC_012523	GCG	2	6	4706	4711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334777
98	NC_012523	CGC	2	6	4736	4741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334777
99	NC_012523	TCC	2	6	4750	4755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334777
100	NC_012523	GC	3	6	4776	4781	0 %	0 %	50 %	50 %	226334777
101	NC_012523	GCCC	2	8	4856	4863	0 %	0 %	25 %	75 %	226334777
102	NC_012523	GAA	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334777
103	NC_012523	ATCT	2	8	5209	5216	25 %	50 %	0 %	25 %	226334778
104	NC_012523	GAG	2	6	5233	5238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226334778
105	NC_012523	CTG	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334778
106	NC_012523	GAT	2	6	5308	5313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334778
107	NC_012523	CGA	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334778
108	NC_012523	GCAC	2	8	5409	5416	25 %	0 %	25 %	50 %	226334778
109	NC_012523	CGA	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334778
110	NC_012523	TGC	2	6	5496	5501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334778
111	NC_012523	GCC	3	9	5616	5624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334778
112	NC_012523	AAG	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334778
113	NC_012523	TGA	2	6	5787	5792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334778
114	NC_012523	TC	3	6	5811	5816	0 %	50 %	0 %	50 %	226334778
115	NC_012523	GCG	2	6	5953	5958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334778
116	NC_012523	CGG	2	6	6306	6311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334779
117	NC_012523	CA	3	6	6349	6354	50 %	0 %	0 %	50 %	226334779
118	NC_012523	GCAA	2	8	6369	6376	50 %	0 %	25 %	25 %	226334779
119	NC_012523	GTC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334779
120	NC_012523	GAG	2	6	6417	6422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226334779
121	NC_012523	GCT	2	6	6467	6472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334779
122	NC_012523	CCCG	2	8	6532	6539	0 %	0 %	25 %	75 %	226334779
123	NC_012523	CCG	2	6	6620	6625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334779
124	NC_012523	ACC	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334779
125	NC_012523	TCG	2	6	6661	6666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334779
126	NC_012523	CGT	2	6	6685	6690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334779
127	NC_012523	GCTG	2	8	6695	6702	0 %	25 %	50 %	25 %	226334779
128	NC_012523	GGC	2	6	6743	6748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334779
129	NC_012523	CGA	2	6	6755	6760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334779
130	NC_012523	CTGG	2	8	6782	6789	0 %	25 %	50 %	25 %	226334779
131	NC_012523	GAG	2	6	6798	6803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226334779
132	NC_012523	CTG	2	6	6861	6866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334779
133	NC_012523	TTC	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226334779
134	NC_012523	ACC	2	6	6876	6881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334779
135	NC_012523	CGA	2	6	6899	6904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334779
136	NC_012523	TCG	2	6	6943	6948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334779
137	NC_012523	CGA	2	6	6956	6961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334779
138	NC_012523	CCCG	2	8	6963	6970	0 %	0 %	25 %	75 %	226334779
139	NC_012523	GAG	2	6	6993	6998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226334779
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141	NC_012523	ACC	2	6	7069	7074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334779
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147	NC_012523	GC	3	6	7277	7282	0 %	0 %	50 %	50 %	226334779
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149	NC_012523	GCGA	2	8	7303	7310	25 %	0 %	50 %	25 %	226334779
150	NC_012523	GCTCCG	2	12	7315	7326	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	226334779
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249	NC_012523	GCGTG	2	10	12989	12998	0 %	20 %	60 %	20 %	226334783
250	NC_012523	GCT	2	6	13015	13020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334783
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254	NC_012523	CCTG	2	8	13119	13126	0 %	25 %	25 %	50 %	226334783
255	NC_012523	GGC	2	6	13163	13168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334783
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258	NC_012523	ACC	2	6	13246	13251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334783
259	NC_012523	ACG	2	6	13256	13261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334783
260	NC_012523	CAG	2	6	13276	13281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334783
261	NC_012523	GAA	2	6	13291	13296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334783
262	NC_012523	GTCG	2	8	13314	13321	0 %	25 %	50 %	25 %	226334783
263	NC_012523	CCG	2	6	13345	13350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334783
264	NC_012523	AGC	2	6	13424	13429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334783
265	NC_012523	GGACCG	2	12	13449	13460	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	226334783
266	NC_012523	CAC	2	6	13529	13534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334783
267	NC_012523	CGG	2	6	13551	13556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334783
268	NC_012523	GGC	2	6	13567	13572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334783
269	NC_012523	TCG	2	6	13589	13594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334783
270	NC_012523	TGCC	2	8	13610	13617	0 %	25 %	25 %	50 %	226334783
271	NC_012523	CGG	2	6	13686	13691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334783
272	NC_012523	GCG	2	6	13711	13716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334783
273	NC_012523	GTC	2	6	13738	13743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334783
274	NC_012523	GTG	2	6	13781	13786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334783
275	NC_012523	CGG	2	6	13788	13793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334783
276	NC_012523	CGG	2	6	13818	13823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334783
277	NC_012523	GCCC	2	8	13845	13852	0 %	0 %	25 %	75 %	226334783
278	NC_012523	GGT	2	6	13899	13904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334783
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280	NC_012523	TGT	2	6	13938	13943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226334783
281	NC_012523	GTC	2	6	14104	14109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334783
282	NC_012523	CGG	2	6	14138	14143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334783
283	NC_012523	GGC	2	6	14169	14174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334783
284	NC_012523	CGT	2	6	14190	14195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334783
285	NC_012523	ACT	2	6	14233	14238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334784
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287	NC_012523	CGG	2	6	14286	14291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334784
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289	NC_012523	GCGA	2	8	14321	14328	25 %	0 %	50 %	25 %	226334784
290	NC_012523	GTT	2	6	14353	14358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226334784
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293	NC_012523	ACC	2	6	14459	14464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334784
294	NC_012523	CCGG	2	8	14510	14517	0 %	0 %	50 %	50 %	226334784
295	NC_012523	GGA	2	6	14566	14571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226334784
296	NC_012523	CCG	2	6	14595	14600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334784
297	NC_012523	GC	3	6	14658	14663	0 %	0 %	50 %	50 %	226334784
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330	NC_012523	CGG	2	6	16110	16115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334785
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372	NC_012523	TCG	2	6	17956	17961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334787
373	NC_012523	GCA	2	6	18081	18086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334787
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379	NC_012523	GCT	2	6	18302	18307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334788
380	NC_012523	CGT	2	6	18325	18330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334788
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382	NC_012523	CGG	3	9	18368	18376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334788
383	NC_012523	GCTC	2	8	18406	18413	0 %	25 %	25 %	50 %	226334788
384	NC_012523	ATC	2	6	18426	18431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334788
385	NC_012523	CGG	2	6	18446	18451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334788
386	NC_012523	CGG	2	6	18470	18475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334788
387	NC_012523	GTC	2	6	18503	18508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334789
388	NC_012523	GCT	2	6	18544	18549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334789
389	NC_012523	ATC	2	6	18575	18580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334789
390	NC_012523	CGG	2	6	18613	18618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334789
391	NC_012523	AGC	2	6	18636	18641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334789
392	NC_012523	CGC	2	6	18664	18669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334789
393	NC_012523	CGG	2	6	18708	18713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334789
394	NC_012523	CGC	2	6	18724	18729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334789
395	NC_012523	TGA	2	6	18764	18769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334790
396	NC_012523	GGC	2	6	18783	18788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334790
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401	NC_012523	ACC	2	6	18853	18858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334790
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404	NC_012523	ACC	2	6	18898	18903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334790
405	NC_012523	CCGC	2	8	18904	18911	0 %	0 %	25 %	75 %	226334790
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421	NC_012523	GCC	2	6	19548	19553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334791
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488	NC_012523	CCCAC	2	10	21873	21882	20 %	0 %	0 %	80 %	226334792
489	NC_012523	GCC	2	6	21885	21890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334792
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497	NC_012523	CGG	2	6	22129	22134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334794
498	NC_012523	ATC	2	6	22205	22210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334794
499	NC_012523	GCT	2	6	22213	22218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334794
500	NC_012523	CGG	2	6	22258	22263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334794

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